Az élelmiszer allergének olyan fehérjék, melyeket az ételallergiás immunrendszer téves módon veszélyesnek ismer fel. Az ételallergiát olyan IgE antitestek közvetítik, amelyek specifikusan kötődnek bizonyos élelmiszerek fehérjéihez. Ennek következtében allergiás reakciót váltanak ki, amely vagy enyhe tünetekben, vagy akár életveszélyes anafilaxiás sokkban nyilvánulhat meg. Néha más antitesteket tartalmazó élelmiszer fogyasztását követően késleltetett immunválasz lép fel.

Mivel az élelmiszer allergén állandó kockázatot jelent az allergiás egyének számára, az élelmiszergyártók részéről rendkívül fontos, hogy termékeiket rutinszerűen teszteljék az esetleges allergén szennyeződés szempontjából.